Choix des modules de l'ED SVSAE

Offres de l'ED SVSAE

En France, les objectifs principaux du doctorat sont pluriels. En plus de la formation par la recherche en laboratoire, un doctorat comprend également des formations collectives (avec des sujets à aborder obligatoirement) et des activités hors-recherche qui doivent contribuer au développement des compétences des futurs docteurs, définies dans l’arrêté du 22 février 2019. 

L'inscription et l'offre pour les modules de l'ED SVSAE est disponible sur ADUM via ce lien :

Offres de l'Etablissement

Attention, la validation d'un ou des modules de Biologie passe par le dépôt sur ADUM de l'attestation de validation de la formation.

Expérimentation animale de Niveau 1 (SVSAE06)

• Langue : français
• Responsable formation : Claude BEAUDOIN (iGRED, claude.beaudoin@uca.fr)
• Public cible : doctorants inscrits à l’Ecole Doctorale des Sciences de la Vie, Santé, Agronomie et Environnement
• Prérequis : avoir un projet scientifique impliquant la conception ou réalisation de procédures expérimentales incluant l’utilisation d’espèces animales
• Durée : 25h00 + 39h00
• Prix : 
  • Module Général : 500.00€
  • Module Rongeurs et lagomorphes : 700.00€
  • Module Animaux de rente : 600.00€
• Nb maximum de participants : 
  • Module rongeurs et lagomorphes : 25 pers. max
  • Module Animaux de rente : 15 pers. max
• Validation : 2 modules de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Agréments :   Cette formation est approuvée par le Ministère de l’Agriculture, de l’Agroalimentaire et de la Forêt sous l’intitulé « Sciences de l’animal de laboratoire »
  • N° d’agrément pour la spécialité « Rongeurs et Lagomorphes » : R-63UnivPASCAL-F1-09
  • N° d’agrément pour la spécialité « Animaux de Rente » : I-63UnivPASCAL-F1-14

Objectifs

Etre capable de pratiquer des expériences sur les animaux vivants dans le respect de la réglementation et de l’éthique (règle des 3 R).

Programme

La formation se compose obligatoirement de 2 modules :

• Un module général obligatoire
• Un module spécifique d’espèces au choix parmi les 2 modules suivants :
  • « Rongeurs et lagomorphes »
  • « Animaux de rente »

Module général : (25 heures)

• Réglementation française appliquée à l’expérimentation animale
• Principes éthiques concernant les relations entre l’homme et l’animal, valeur intrinsèque de la vie et arguments pour ou contre l’utilisation d’animaux à des fins scientifiques. Règle des 3 R ; rôle et fonctionnement des comités d’éthique
• Ethique appliquée, mise en oeuvre des 3R
• Méthodes alternatives (principes généraux)
• Méthodes alternatives mise en oeuvre dans la conception du projet
• Connaissances de base de la biologie comparative des espèces : critères de choix du modèle
  • Recours aux points limites adaptés : mise en oeuvre
  • Recours aux points limites adaptés : critères de choix des points limites
  • Méthodes d’Euthanasie : principes généraux
  • Evaluation

Modules spécifiques : (39 heures)

• Procédures expérimentales faiblement invasives : éléments théoriques par groupe d’espèces
• Procédures expérimentales faiblement invasives : éléments pratiques par groupe d’espèces
• Connaissances de base de la biologie pour un groupe d’espèces,
• Reconnaissance des signes de détresse de douleur et de souffrance propres aux espèces
• Anesthésie analgésie pour le groupe d’espèces considéré 
• Méthodes d’euthanasie par espèce
• Gestion et suivi de la santé animale et de l’hygiène
• Équipements et matériel d’animalerie : description, utilisation, entretien (module animaux de rente), 
• Conception des procédures expérimentales et des projets
• Evaluation

Initiation à la chirurgie expérimentale des rongeurs (SVSAE07)

• Langue : français
• Responsable formation : Jean-Christophe Pointud (j-christophe.pointud@uca.fr ; iGRED)
• Public cible : doctorants inscrits à l’Ecole Doctorale des Sciences de la Vie, Santé, Agronomie et Environnement. La formation à la chirurgie est nécessaire pour les personnes amenées à pratiquer des actes chirurgicaux sur les animaux utilisés à des fins scientifiques (Arrêté du 1er février 2013 relatif à l’acquisition et à la validation des compétences des personnels utilisateurs, éleveurs et fournisseurs d’animaux utilisés à des fins scientifiques)
• Prérequis : Formation expérimentation animale niveau 1 ou niveau 2 ou formation pour les personnels concevant ou appliquant des procédures expérimentales aux animaux.
• Durée : -
• Prix : 1100€
• Nb maximum de participants : 20 pers. max
• Validation : 2 modules de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Agréments :   Cette formation est approuvée par le Ministère de l’Agriculture, de l’Agroalimentaire et de la Forêt sous l’intitulé « Sciences de l’animal de laboratoire »
  • N° d’agrément pour la spécialité « Rongeurs et Lagomorphes » : R-63UnivPASCAL-F1-09
  • N° d’agrément pour la spécialité « Animaux de Rente » : I-63UnivPASCAL-F1-14

Objectifs

• Obtenir l’autorisation de pratiquer des actes chirurgicaux sur les animaux.
• Cette formation est approuvée par le ministère de l’agriculture (R-63UnivPASCAL-Chir-09).
• Cette formation réglementaire est spécialisée dans les rongeurs.

Programme

• Organisation de la chirurgie animale
• Phase préopératoire : antisepsie, asepsie, matériel, locaux
• Prémédication, anesthésie, monitoring, analgésie, mise à mort
• Actes élémentaires : incision, hémostase, dissection, sutures
• Actes spécifiques :
  • cathétérisme,
  • implantation chronique
  • Exérèse
  • Implantation d’ovocytes
  • Suivi et soins post opératoires

Formation pour Application des procédures expérimentales sur animaux vivants (niv2) (SVSAE08)

• Langue : français
• Responsable formation : Claude BEAUDOIN (iGRED, claude.beaudoin@uca.fr) avec l'intervention de maîtres de conférences UCA, docteurs vétérinaires, professeurs UCA
• Public cible : doctorants inscrits à l’Ecole Doctorale des Sciences de la Vie, Santé, Agronomie et Environnement et ayant déjà suivi la formation “Expérimentation Animale de Niveau 1” ou une formation équivalente
• Prérequis : formation “Expérimentation Animale de Niveau 1” ou une formation équivalente
• Durée : 5 jours (45h)
• Prix : 1000€
• Nb maximum de participants : 24 pers. max
• Validation : 2 modules de l’Ecole Doctorale SVSAE

Objectifs

Maîtriser la théorie et la pratique de l'expérimentation sur animaux vivants conformément à la législation en vigueur (Directive Européenne 2010/63UE et décret du 1er février 2013 en la matière). Formation adressée aux personnels techniciens, étudiants appliquant les procédures sur animaux vivants (rat -souris exclusivement).

Programme

Module bases (13h00)

• Réglementation (2h)
• Ethique (2h)
• Méthodes alternatives (2h)
• Biologie comparative des espèces (3h)
• Points limites (2h)
• Mise à mort (2h)

Module Spécialisation rongeurs (36h00)

• Procédures faiblement invasives (3h cours + 4h TD)
• Conception procédures / projets (2h cours)
• Hygiène et sécurité (2h cours)
• Physiologie anatomie (2h cours)
• Génétique (2h cours)
• Comportement éthologie (2h cours+ 4h TP)
• Méthodes de mise à mort (2h cours)
• Zoonoses, Santé animale (2h cours)
• Transport Réception Logement des animaux (2h cours)
• Anesthésie analgésie (2h cours)
• Stress Douleur (2h cours)
• Contrôle (1h)

Modules en externe (liste non-exhaustive)

Liste des Modules en externe

Vous pouvez valider d’autres modules proposés en dehors de l’environnement UCA.
Les règles pour les valider sont :

• la formation relève du champ disciplinaire du/de la doctorant.e et/ou présente un intérêt avéré dans le cadre de sa thèse ;
• la formation a une durée effective d’au moins 14h00 ;
• le/la doctorant.e demande l’accord préalable pour suivre la formation à la direction de l’Ecole Doctorale.

D’un point de vue pratique, vous écrirez à : edsvsae.dred@uca.fr un mail type tel que :

Bonjour,
Actuellement doctorant.e en XXXX (spécialité) au sein de l’unité de recherche XXXX (nom du labo),
j’ai vu la formation intitulé XX (nom de la formation),
proposée par XX (nom de l’entité proposant la formation),
ayant lieu les XX/XX/XXXX et XX/XX/XXXX,
pour une durée de XX heures.
Cette formation présente l’intérêt suivant dans le cadre de ma thèse : XXXX (au moins une phrase)
Ainsi, Madame, Monsieur, je vous sollicite aujourd’hui pour savoir si le fait de suivre cette formation pourrait me permettre de valider par équivalence un module de l’Ecole Doctorale SVSAE.
Vous remerciant par avance,
Bien cordialement.

Si vous disposez d’un document Word ou Pdf détaillant le programme et les informations de base demandées ici, n’hésitez pas à le joindre en pièce jointe lors de votre email de demande.

• le/la doctorant.e doit fournir un document issu de l’organisateur, justifiant de sa présence lors de la formation/événement.

Aussi, vous trouverez ci-après une liste de formations hors catalogue déjà reconnues par l’Ecole Doctorale des Sciences de la Vie, Santé, Agronomie et Environnement.

Présentation du comité d'éthique en expérimentation animale

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 Télécharger( comite-ethique-en-experimentation-animale_1762427062254-pdf?ID_FICHE=1087276&INLINE=FALSE )

Concernant le volume de l'UE/an:

1ere année: (20h)

-Evaluer 4 DAP/an (travail encadré par un référent expert du comité)= 8h

-Participer à 4 Réunions (1h à 1h30 en réalité c'est plutôt 1h30)= 6h

-1/2 de formation par formateur externe (rédaction-évaluation des DAP) environ 6 h

2eme année (18 à 20h):

-Evaluer 4 DAP/an (travail encadré par un référent expert du comité)= 8h

-Participer à 4 Réunions (1h à 1h30 en réalité c'est plutôt 1h30)= 6h

-1/2 de formation par formateur externe (approfondissement du design expérimental-outil statistique; évaluation du nombre d'animaux) 4 à 6 h

Validation : un module de l'ED SVSAE par année suivie

Métagénormique environnementale ou comment explorer une communauté de micro-organismes sans la cultiver

• Langue : français
• Inscription : pour vous inscrire à cette formation, veuillez écrire à : gestionnaire-codusmb.ddrv@univ-smb.fr en donnant votre matricule ADUM
• Durée : 1 semaine (32h30)
• Prix : Gratuit
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE

Objectifs

À la fin du cours, l'étudiant devrait possé der les connaissances suivantes :

• Diversité taxonomique et fonctionnelle des microbes dans différents écosystèmes
• Intéractions microbienne
• Évolution et adaptation des microbes
• Méthodes d'analyses des structures des communauté s microbiennes
• Compréhension et analyse de données de métagénomique environnementale.

1.  d'acquérir des notions de base en microbiologie environnementale et notamment
   1.  Acquérir des connaissances sur la diversité , les fonctions et les interactions des micro-organismes dans les milieux aquatiques,
   2. Comprendre les adaptations évolutives des microbes face aux changements environnementaux et interventions anthropiques.
2. Ce cours traitera aussi des méthodes d'analyses des structures des communautés microbiennes (méthodes conventionnelles, biologie moléculaire, génomique microbienne et métagénomique) avec un focus sur la métagénomique environnementale. Cette approche est un outil puissant car elle donne accès aux génomes des micro-organismes non cultivés. Elle permet non seulement de caractériser la diversité taxonomique, mais aussi la composition fonctionnelle des communautés microbiennes.

Programme

À travers ce module, vous aurez des cours magistraux (2h30 x 5), des travaux pratiques (16h) et dirigés (4h) afin d'apprendre à caractériser une communauté microbienne aquatique de l'échantillonnage à l'analyse des données de séquençage qu'ils génèrent eux même. Pendant ce cours d'une semaine, vous apprendrez des approches bioinformatiques pour analyser les données métagénomiques en incluant l'analyse des reads (taxonomique et fonctionnelle), leur assemblage, et comment construire des génomes assemblés par les métagenomes (MAGs).
Ce cours se fera sur le site de CARRTEL, à Thonon les bains, et durera une semaine complète (du 20 au 24 Janvier 2025).

Formation proposée par une autre Ecole Doctorale ou un EPST (CNRS, INSERM, INRAE, …)

• Langue : français, anglais, autres
• Durée : 12h minimum
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : vous devrez vous débrouiller en ce qui concerne l’inscription à une formation hors de notre établissement.
  Vous pouvez vous adresser à votre gestionnaire via : edsvsae.dred@uca.fr au cas où l’organisateur de la formation vous demande des preuves concernant votre inscription en Diplôme National de Doctorat à l’EPE Université Clermont Auvergne.
  Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” en y renseignant :
  • le nom
  • l’organisateur
  • les dates
  • la durée en heures
  • le lieu (si distanciel, le mentionner)
  • les objectifs
  • le programme (cela peut-être une synthèse en quelques points ou bien une phrase de résumé)
  • UNE ATTESTATION DE PARTICIPATION SIGNÉE (cela peut également être un badge numérique à nous transmettre non signé)

Cours de Master suivi PENDANT la période de Thèse  - Proposés par une composante de l’EPE Université Clermont Auvergne

• Langue : français, anglais
• Durée : 14h minimum (une UE de Master faisant généralement 24h00, il est tout de même encouragé de participer à l’intégralité de la formation)
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Offre disponible à l'UCA : https://www.uca.fr/formation/nos-formations/catalogue-des-formations/par-type-de-diplome/masters
• Inscription : Pour l’inscription sur une UE, rapprochez-vous du secrétariat de la composante en charge du Master concerné.
  Vous pouvez vous adresser à votre gestionnaire via : edsvsae.dred@uca.fr au cas où l’inscription tarde..
  Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” en y renseignant :
  • le nom de l’UE (ex : UE 224 Evaluation médico économique)
  • la mention du Master au sein duquel s’inscrit l’UE (ex : Master Santé Publique - Parcours 2 Evaluation en Santé [EVAL])
  • la composante organisatrice de la formation (ex : UFR de Médecine et des Professions Paramédicales)
  • le semestre de l’UE (ex : 1er semestre 2023-2024)
  • la durée en heures à laquelle vous avez assisté
  • les objectifs
  • le programme (cela peut-être une synthèse en quelques points ou bien une phrase de résumé)
  • UNE ATTESTATION DE PARTICIPATION SIGNÉE (cela peut également être un badge numérique à nous transmettre non signé)

Séjour de formation en laboratoire externe à l’Ecole Doctorale SVSAE ou une entreprise

• Langue : -
• Durée : 3 jours MINIMUM
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” sous le nom : “SVSAE_Séjour externe en laboratoire/entreprise_XXXX_202X” où “XXXX” est le nom du laboratoire d’accueil ou l’entreprise et “202X” l’année de réalisation.
  Vous devez renseigner :
  • le nom de l’Unité de Recherche ou de l’Entreprise
    • Pour une Unité de Recherche :
      • NOM de l’unité (ex : Laboratoire de Physique de Clermont-Ferrand)
      • Code de l’unité (ex : UMR 6533)
      • Tutelle de l’unité (ex : UMR Université Clermont Auvergne + CNRS)
      • Adresse de l’unité (ex : 4 Av Blaise Pascal, 63170 AUBIERE, FRANCE)
    • Pour une Entreprise privée :
      • NOM de l’entreprise (ex : BOBO pharmaceutics)
      • SIRET de l’entreprise (ex : XXXXXXXX 00066 )
      • Adresse du site de séjour en entreprise (ex : 2 rue Victor Hugo, 63000 Clermont-Ferrand)
  • le nom de votre référent hiérarchique durant la période de séjour
    • NOM
    • Prénom
    • Statut/Fonction (Chercheur, MCF, PU, IGR, IGE si laboratoire ; nom du poste si entreprise)
  • la période du séjour (ex : 11/04/2023 → 09/05/2023)
  • la durée en heures du séjour
  • les objectifs du séjour (sous un format en points, avec au moins trois points)
  • un résumé des travaux et/ou missions effectuées (5-10 lignes)

Encadrement de stagiaires

• Langue : -
• Durée : 3 semaines
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” sous le nom : “SVSAE_Encadrement de stagiaire 202X” où “202X” est l’année de réalisation.
  Vous devrez renseigner :
  • Niveau du stagiaire (3ème, 2nd, 1ère, Licence)
  • Temps de présence du stagiaire sur votre lieu de travail
  • Nature des missions/tâches/actions données et/ou conduites avec le stagiaires (pas besoin de tout énumérer)
• Justificatif : Chaque convention de stage, au sein desquelles vous devrez être désigné comme tuteur.trice de stage, devront être déposées comme pièces justificatives.

Programme

Si vous encadrez :

• un stagiaire d’observation de 3ème ou au lycée
• un stage d’étudiant de 3ème année de Licence

pour une durée totale CUMULÉE égale ou supérieure à 3 semaines, vous validerez 1 module de l’ED SVSAE.
Notez bien que :

• ce module peut-être validé “à cheval” sur plusieurs années de thèse. Si vous êtes en capacité de prouver que vous avez, par exemple, accueilli en stage un.e élève de seconde pendant une semaine en 2023, un.e étudiant.e de licence pendant deux semaines en 2024, alors vous validerez le module. L’important est que le total des différents stages dont vous avez été le tuteur.trice soit de 3 semaines.
• ce module ne peut être validé qu’une seule fois, il n’y aura de double validation si vous accueillez des stagiaires pendant 6 semaines cumulées.

Communication orale en anglais lors d’un congrès international et présence à la totalité de ce congrès (hors poster)

• Langue : anglais
• Durée : variable selon événement (entre une journée et 3 jours)
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” en y renseignant sous le nom “SVSAE_Communication orale lors d’un Congrès International : XXXX_202X” où “XXXX” est le nom du congrès et “202X” l’année de réalisation.
  Devront figurer les informations suivantes :
  • Nom du congrès/séminaire
  • Organisateur du congrès/séminaire
  • Dates du congrès/séminaire
  • Lieu du congrès/séminaire
  • Durée de votre intervention orale
• Justificatif : 
  • attestation de participation signée des organisateurs du congrès ;
  • un mail de confirmation de participation ou un document pdf du programme contenant mention de votre intervention

Organisation des Journées Scientifiques de l’Ecole Doctorale SVSAE

• Langue : -
• Durée : variable (il s’agit d’un investissement conséquent sur les semaines précédant l’événement ; courant juin)
• Validation : 2 modules de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” sous le nom : “SVSAE_Organisation des Journées Scientifiques de l’ED SVSAE 202X”
• Justificatif : L’organisation des JED se faisant en étroite collaboration avec la direction de l’ED SVSAE, votre investissement sera reconnu directement par la direction de celle-ci.

Programme

Chaque année, l'École Doctorale des Sciences de la Vie, de la Santé, de l’Agronomie, et de l’Environnement organise les Journées scientifiques de l'École Doctorale (JEDs), au cours desquelles les doctorants ont l'opportunité de présenter leurs travaux de thèse. Les meilleures présentations, orales ou écrites (posters), seront récompensées par un jury composé de chercheurs dont les domaines de compétence balayent une grande majorité de la recherche clermontoise en biologie.
Considérant la population importante de l’Ecole Doctorale SVSAE (environ 250 doctorant.e.s chaque année, toute année confondues), les JED sont un événement qui rassemble et crée l’opportunité de rencontres et d’échanges pluridisciplinaires.
L’organisation est le fruit du travail de la direction de l’Ecole Doctorale et d’un groupe de doctorant.e.s (env. 5-8) et l’ED tient à les remercier au travers d’une reconnaissance de deux modules de l’ED SVSAE.

Faire partie du Conseil Scientifique de l’Ecole Doctorale

• Langue : -
• Durée : il s’agit d’un investissement sur la durée, vous participerez au réunion du Conseil durant l’année.
• Validation : 1 module de l’Ecole Doctorale SVSAE
• Inscription : Une fois votre requête de validation par email acceptée, vous devrez déclarer la formation via ADUM dans “Formation Hors Catalogue” sous le nom : “SVSAE_Membre du Conseil de l’Ecole Doctorale_202X”
• Justificatif : L’organisation et la tenue des conseils se faisant en étroite collaboration avec la direction de l’ED SVSAE, votre investissement sera reconnu directement par la direction de celle-ci..

Description

le Conseil Scientifique de l’Ecole Doctorale réunit des Enseignants-Chercheurs et les acteurs investis dans la vie scientifique de l’Ecole Doctorale. Celui-ci prend les décisions concernant la politique d'attribution des allocations de recherche, l'organisation d'enseignements, l'organisation des comités de suivi de thèse, l'organisation du concours de l'ED et la mise en place d'actions particulières. Des places sont réservées à des doctorants.